Gonzo zastanawia się właśnie, skąd pochodzi jego rodzina gdy dowiaduje się, że odwiedzą go bardzo dalecy krewni... z kosmosu!. Wieść o tym dociera również do tajnej agencji rządowej i Gonzo zostaje porwany. Agenci są gotowi zrobić wszystko, żeby poznać datę przybycia gości z pozaziemskiej cywilizacji. Tylko Muppety pod wodzą nieustraszonej świnki Piggy oraz jej zaufanego pomocnika - żaby Kermita mogą uratować Gonza. Sprawią, że świat będzie przygotowany na inwazję przyjaźnie nastawionych Obcych. "Muppety z Kosmosu" (z udziałem Andie MacDowell) to gwiezdne spotkanie trzeciego stopnia z nieziemską zabawą.